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    用于細胞免疫治療的組合物和方法技術

    技術編號:26609672 閱讀:83 留言:0更新日期:2020-12-04 21:35
    本公開內容提供了包含修飾的CD28共刺激信號傳導域的融合蛋白及其在免疫療法中的用途,該療法用于治療癌癥。在一些實施方案中,提供了表達融合蛋白并在細胞免疫療法中用于治療癌癥和其他疾病的宿主免疫細胞。在某些實施方案中,融合蛋白包含根據本發明專利技術的嵌合抗原受體(CAR)。

    【技術實現步驟摘要】
    【國外來華專利技術】用于細胞免疫治療的組合物和方法關于序列表的聲明與本申請相關聯的序列表以文本格式代替紙質副本提供,并且據此通過引用結合到說明書中。包含序列表的文本文件的名稱為360056_458WO_SEQUENCE_LISTING.txt。文本文件為274KB,其創建于2019年2月20日,正在通過EFS-Web電子提交。政府權益聲明本專利技術是在美國國立衛生研究院授予CA114536的政府支持下完成的。政府擁有本專利技術的某些權利。
    技術介紹
    使用針對癌癥抗原的經基因工程改造的受體修飾的T細胞進行的過繼免疫療法已證明在血液系統癌癥中具有臨床成功,并顯示出在治療其他癌癥和疾病中的潛力。工程化的受體包括嵌合抗原受體(CAR)和增強的親和力T細胞受體(TCR)。參見,例如,Harris和Kranz,TrendsPharmacol,Sci.37(3):220(2016)。通過工程改造的受體與癌癥抗原結合后,修飾的T細胞通過誘導靶腫瘤細胞的細胞溶解并釋放細胞因子來刺激免疫反應,從而介導抗腫瘤反應。除抗原驅動的刺激外,CAR和TCR還可在T細胞中表現出強直性(非抗原依賴性或組成性)或過度信號傳導。高表面表達、工程受體的自我聚集特性(例如,scFv寡聚)、在γ逆轉錄病毒載體中的表達以及某些共刺激信號域的存在可能有助于滋補和/或過度的信號傳導(Gomes-Silva等人,CellReports21:17-26(2017);Long等人,Nat.Med.21:581-590(2015);Frigault等人,CancerImmunol.Res.3:356-367(2015))。進補和/或過度信號傳導可導致轉導T細胞的組成性激活和增殖、加速T細胞分化、限制T細胞持久性、增加T細胞疲勞、增加T細胞凋亡、增加免疫檢查點分子受體的表達(例如PD-1、TIM-3和AG-3)和/或降低T細胞的抗腫瘤活性(Gomes-Silva等,同上;Frigault等,同上;Long等,同上;Eyquem等,Nature543:113(2017))。此外,CART細胞療法還與明顯的毒性相關,包括細胞因子釋放綜合征(CRS)和CART細胞相關性腦病綜合征(CRES)。細胞因子釋放綜合征是指與T細胞活化和增殖相關的細胞因子水平升高引起的全身性炎癥反應。CRS可能是輕度的、自限性的、伴有發燒和肌痛的癥狀,甚至更嚴重,伴有血管滲漏、低血壓、呼吸和腎臟功能不全、血細胞減少、凝血病、多器官功能衰竭和神經系統毒性的癥狀。神經毒性可能表現為多種神經和精神癥狀,包括癲癇發作、神志失常、失語癥和幻覺。CRES可與CRS同時或之后發生,并可能導致致命的腦水腫。因此,在過繼性細胞療法中需要新的策略來治療癌癥。當前公開的實施例解決了這些需求并提供了其他相關的優點。附圖說明圖1A-1G顯示在CD28/CD3ζ和4-1BB/CD3ζCAR的間隔區中包含(STII)標簽提供了一種激活嵌合抗原受體(CAR)信號傳導的精確方法。圖1A:示意圖STIICAR設計在細胞外鉸鏈中包含單個STII序列。CAR包含CD19特異性FMC63scFv(SEQIDNO:8)或ROR1特異性R12scFv(SEQIDNO:9)。圖1B:STIICART細胞與涂有STIImAb的STII磁珠結合的示意圖。圖1C:CD19+LCL擴增后分選純化的CD19特異性CART細胞的代表性FACS圖。圖1D和1E:代表性FACS圖顯示了細胞表面CAR的STII染色(D)和分選純化的CD19特異性CD19的表型(E)或擴增后的ROR1特異性CART細胞。虛線:CD28/CD3ζCART細胞,實線:4-1BB/CD3ζCART細胞,陰影直方圖:同種型對照。圖1F:代表性的FACS圖顯示了CART細胞的DNA含量染色。門控量化了G0/G1中細胞的頻率。圖1G:用不同數量的STII磁珠、K562細胞或ROR1共培養45分鐘后,分析從CART細胞(4-1BB/CD3ζ)制備的裂解物的蛋白質印跡。將裂解物印跡到PLC-γ1pY783、PLC-γ1、SLP-76pS376、SLP-76、CD247pY142和CD247。圖1C-1F中的數據代表了四個獨立的實驗。圖1G中的印跡代表兩個獨立的實驗。圖2A-2G對CAR磷蛋白信號進行定量分析,表明CAR通過內源性T細胞信號蛋白進行信號傳遞。圖2A和2B:CART細胞刺激條件和實驗設計。圖2C:圖2C:條形圖顯示了在圖2A和2B中所述的三種質譜(MS)實驗中鑒定出的獨特的磷酸絲氨酸(“pS”),磷酸蘇氨酸(“pT”)和磷酸酪氨酸(“pY”)位點的總數。圖2D:Venn圖顯示了在所有MS實驗中檢測到的PO4位點之間的重疊。圖2E和2F:散點圖顯示了在CAR刺激10分鐘(E)和45分鐘(F)之后規范性TCR信號PO4事件的平均和log2倍變化范圍。圖2G:10和45分鐘裂解物的蛋白質印跡分析刺激CD28/CD3ζ和4-1BB/CD3ζ+CART細胞。印跡代表圖2A和2B中描述的三個獨立實驗。圖3A-3F顯示CD28/CD3ζ或4-1BB/CD3ζCAR刺激以不同的動力學和強度調節相似的蛋白質磷酸化事件。圖3A-3D:火山圖顯示已鑒定PO4位點的log2倍變化和假發現率(FDR)由MS在兩個或多個實驗中進行。使用Limma定義符合CAR刺激的PO4位置(火山圖的左上(C,D)和右上(A,C,D)部分的灰點),滿足log2倍變化和FDR截止值。圖3E:散點圖在45分鐘的時間點比較CD28/CD3ζ和4-1BB/CD3ζCAR刺激響應的PO4位點。網格中上部和中下部的灰點(由虛線定義;包括灰點)垂直的“0”線)表示受4-1BB/CD3ζCAR刺激更強烈地調節的PO4位點。網格右下部和左上部的淺灰色點表示CD28/CD3ζCAR刺激反應性PO4位點,其被4-1BB/CD3ζCAR刺激以相反的方向調制。圖3F:散點圖顯示了平均值刺激后,已知CD28和4-1BB信號通路成員的PO4位點的log2倍變化范圍和范圍。圖4顯示CD28/CD3ζ或4-1BB/CD3ζCAR刺激改變了類似信號通路和細胞區室的蛋白質磷酸化。來自所有MS實驗分析的CART細胞刺激45分鐘后,差異蛋白磷酸化的選擇蛋白圖譜。圖5A-5C顯示,與4-1BB/CD3ζCAR刺激相比,CD28/CD3ζCAR刺激在蛋白質PO4中產生更大的幅度變化。圖5A:點圖顯示CAR刺激后20個最磷酸化位點的平均log2倍變化。圖5B:點圖顯示在CAR刺激后,在已知KEGGTCR信號通路蛋白上檢測到的每個PO4位點的絕對log2倍變化。因為在CAR激活后某些位點被去磷酸化,所以絕對log2倍變化用于量化PO4改變的幅度。圖5C:用STII磁珠刺激給定時間的CART細胞的Western印跡分析。印跡代表3個獨立實驗。圖5A和5B中的P值是使用未配對的兩樣本t檢驗計算的。圖6A-6K顯示了CD28/CD3ζCAR信號促進了效應細胞樣表型,體內抗腫瘤活性降低。圖6A-6B:條形圖顯示了與刺激的對照CD28/CD3ζ或4-1BB/CD本文檔來自技高網...

    【技術保護點】
    1.一種融合蛋白,其包含:/n(a)包含特異性結合靶抗原的結合域的細胞外組分;/n(b)包含修飾的功能性CD28共刺激信號結構域的細胞內組分,其中所述修飾的功能性CD28共刺激信號結構域包含至少一個氨基酸取代;和/n(c)位于細胞外組分和細胞內組分之間的疏水部分,/n其中所述融合蛋白具有與包含野生型CD28共刺激信號結構域的融合蛋白不同的一種或多種功能活性。/n

    【技術特征摘要】
    【國外來華專利技術】20180226 US 62/635,450;20180525 US 62/676,787;20181.一種融合蛋白,其包含:
    (a)包含特異性結合靶抗原的結合域的細胞外組分;
    (b)包含修飾的功能性CD28共刺激信號結構域的細胞內組分,其中所述修飾的功能性CD28共刺激信號結構域包含至少一個氨基酸取代;和
    (c)位于細胞外組分和細胞內組分之間的疏水部分,
    其中所述融合蛋白具有與包含野生型CD28共刺激信號結構域的融合蛋白不同的一種或多種功能活性。


    2.權利要求1的融合蛋白,其中CD28共刺激信號傳導域中的至少一個酪氨酸殘基由不同的氨基酸殘基取代。


    3.權利要求2的融合蛋白,其中所述至少一個酪氨酸殘基選自位置191、206、209和218中的任何一個。


    4.權利要求2的融合蛋白,其中選自位置191、206、209和218中任一個的至少兩個酪氨酸殘基各自由不同的氨基酸殘基取代。


    5.權利要求2的融合蛋白,其中選自位置191、206、209和218中任一個的至少三個酪氨酸殘基各自由不同的氨基酸殘基取代。


    6.權利要求2的融合蛋白,其中在位置191、206、209和218的四個酪氨酸殘基由不同的氨基酸殘基取代。


    7.權利要求2-6中任一項的融合蛋白,其中每個酪氨酸殘基獨立地由色氨酸殘基或苯丙氨酸殘基取代。


    8.權利要求2-6中任一項的融合蛋白,其中每個酪氨酸殘基由苯丙氨酸殘基取代。


    9.權利要求2-6中任一項的融合蛋白,其中每個酪氨酸殘基由色氨酸殘基取代。


    10.權利要求2-7中任一項的融合蛋白,其中所述修飾的CD28共刺激信號傳導結構域包含Y218F取代。


    11.權利要求2-7中任一項的融合蛋白,其中所述修飾的CD28共刺激信號傳導域包含Y206F、Y209F和Y218F取代。


    12.權利要求2-7中任一項的融合蛋白,其中所述修飾的CD28共刺激信號傳導域包含Y191F、Y206F、Y209F和Y218F取代。


    13.權利要求1-12中任一項的融合蛋白,其中所述CD28共刺激信號域中的至少一個脯氨酸殘基由不同的氨基酸殘基取代。


    14.權利要求13的融合蛋白,其中所述至少一個脯氨酸殘基選自位置196、199、208和211中的任何一個。


    15.權利要求13的融合蛋白,其中選自位置196、199、208和211中的任一個的至少兩個脯氨酸殘基各自由不同的氨基酸殘基取代。


    16.權利要求13的融合蛋白,其中選自位置196、199、208和211中任一個的至少三個脯氨酸殘基各自由不同的氨基酸殘基取代。


    17.權利要求13的融合蛋白,其中在196、199、208和211位的四個脯氨酸殘基由不同的氨基酸殘基取代。


    18.權利要求13-17中任一項的融合蛋白,其中每個脯氨酸殘基由丙氨酸殘基取代。


    19.權利要求1-18中任一項的融合蛋白,其中所述修飾的CD28共刺激信號傳導域還包含L186和L187取代。


    20.權利要求19的融合蛋白,其中所述L186取代為L186G,所述L187取代為L187G。


    21.權利要求1-11、13-15和18-20中任一項的融合蛋白,其中所述修飾的CD28共刺激信號結構域在Y191、P208、P211或其任何組合上不包含取代。


    22.根據權利要求1-21中任一項所述的融合蛋白,其中所述結合結構域是scFv、scTCR、受體胞外域或配體。


    23.權利要求1-22中任一項的融合蛋白,其中所述結合結構域不包含CD8的細胞外結合結構域或部分或其包含功能性IgV樣結構域的任何部分。


    24.根據權利要求23所述的融合蛋白,其中所述結合結構域不包含來自CD8α鏈的結合結構域、來自CD8β鏈的結合結構域、來自CD8α同二聚體的結合結構域,或來自CD8αβ異二聚體的結合結構域。


    25.根據權利要求1至24中任一項所述的融合蛋白,其中所述結合結構域是嵌合的、人的或人源化的。


    26.根據權利要求1至25中任一項所述的融合蛋白,其中所述細胞外組分還包括位于所述結合結構域和所述疏水性部分之間的間隔子。


    27.根據權利要求26所述的融合蛋白,其中所述間隔物包含免疫球蛋白鉸鏈區,CH2結構域、CH3結構域或其任何組合。


    28.根據權利要求27所述的融合蛋白,其中所述免疫球蛋白鉸鏈區是IgG4鉸鏈區。


    29.根據權利要求1-28中任一項所述的融合蛋白,其中所述細胞外組分還包含位于所述結合結構域和所述疏水性部分之間的標簽。


    30.根據權利要求29所述的融合蛋白,其中所述標簽具有Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys的氨基酸序列(SEQIDNO:40)。


    31.根據權利要求1至30中任一項所述的融合蛋白,其中所述細胞內組分還包含含ITAM的T細胞活化域。


    32.權利要求31的融合蛋白,其中所述含ITAM的T細胞活化結構域包含CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD3ζ、FcεRI的γ鏈或FcγRI的γ鏈的細胞內信號傳導域。


    33.根據權利要求32所述的融合蛋白,其中所述細胞內組分還包含CD3ζ細胞內信號傳導結構域。


    34.根據權利要求1-33中任一項所述的融合蛋白,其中所述細胞內組分還包含至少一個另外的共刺激信號傳導域。


    35.根據權利要求34所述的融合蛋白,其中所述至少一個另外的共刺激信號傳導結構域選自CD27、CD40L、GITR、NKG2C、CARD1、CD2、CD7、CD27、CD30、CD40、CD54(ICAM)、CD83、CD134(OX-40)、CD137(4-1BB)、CD150(SLAMF1)、CD152(CTLA4)、CD223(LAG3)、CD270(HVEM)、CD273(PD-L2)、CD274(PD-L1)、CD278(ICOS)、DAP10、LAT、NKD2CSLP76、TRIM、ZAP70、CD5、BAFF-R、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3、與CD83特異性結合的配體或其組合。


    36.根據權利要求1-35中任一項所述的融合蛋白,其中所述疏水部分是跨膜結構域。


    37.根據權利要求36所述的融合蛋白,其中所述跨膜結構域包含CD28、CD2、CD3ε、CD3δ、CD3ζ、CD25、CD27、CD40、CD79A、CD79B、CD80、CD86、CD95(Fas)、CD134(OX40)、CD137(4-1BB)、CD150(SLAMF1)、CD152(CTLA4)、CD200R、CD223(LAG3)、CD270(HVEM)、CD272(BTLA)、CD273(PD-L2)、CD274(PD-L1)、CD278(ICOS)、CD279(PD-1)、CD300、CD357(GITR)、A2aR、DAP10、FcRα、FcRβ、FcRγ、Fyn、GAL9、KIR、Lck、LAT、LRP、NKG...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:A·索爾特S·里德爾
    申請(專利權)人:弗雷德哈欽森癌癥研究中心
    類型:發明
    國別省市:美國;US

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