本發(fā)明專利技術(shù)屬于生物醫(yī)藥領(lǐng)域，具體涉及一種診斷及預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后的分子標(biāo)志物。具體地，PANK3在正常組織/癌旁組織中的表達(dá)顯著高于癌癥組織，PANK3表達(dá)量高的受試者有更好的預(yù)后；并且多因素Cox回歸分析顯示，在校正年齡、性別和臨床分期的影響后，PANK3仍是結(jié)直腸癌病人的獨(dú)立預(yù)后因子。
【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于生物醫(yī)藥領(lǐng)域，具體涉及一種診斷及預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后的分子標(biāo)志物。
技術(shù)介紹
1、結(jié)直腸癌(colorectalcancer，crc)是威脅我國居民生命健康的主要癌癥之一，造成了嚴(yán)重的社會(huì)負(fù)擔(dān)。根據(jù)國家癌癥中心公布的最新數(shù)據(jù)，2015年中國結(jié)直腸癌新發(fā)病例38.76萬例，占全部惡性腫瘤發(fā)病的9.87％；由結(jié)直腸癌導(dǎo)致的死亡病例18.71萬例，占全部惡性腫瘤死亡的8.01％。如何有效地降低我國結(jié)直腸癌疾病負(fù)擔(dān)是亟待解決的重大公共衛(wèi)生問題。
2、結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展大多遵循“腺瘤—癌”序列，從癌前病變進(jìn)展到癌一般需要5～10年的時(shí)間，為疾病的早期診斷和臨床干預(yù)提供了重要時(shí)間窗口。此外，結(jié)直腸癌的預(yù)后與診斷分期緊密相關(guān)。i期結(jié)直腸癌的5年相對生存率為90％，而發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的ⅳ期結(jié)直腸癌5年相對生存率僅為14％。結(jié)腸癌的分期比較復(fù)雜，實(shí)際上是根據(jù)原發(fā)灶對腸壁各個(gè)層次的浸潤深度，以及有沒有淋巴結(jié)和遠(yuǎn)處器官的轉(zhuǎn)移進(jìn)行分期。對于沒有區(qū)域性淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的患者，如果浸潤深度僅局限在肌層以內(nèi)，叫做i期，如果浸潤深度達(dá)到漿膜層以及漿膜外侵犯到鄰近的器官稱為ii期，如果出現(xiàn)腸周淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移，則進(jìn)入iii期，再進(jìn)一步出現(xiàn)遠(yuǎn)處器官的轉(zhuǎn)移，稱為ⅳ期的病變。
3、結(jié)直腸癌的篩查方法主要包括糞便隱血檢測與腸鏡檢查。其中，糞便隱血檢測敏感性與特異性較低；腸鏡檢查雖然準(zhǔn)確度高，但屬于侵入性檢測，患者依從性低。隨著人類基因組計(jì)劃的完成以及高通最測序技術(shù)的發(fā)展，基因篩查技術(shù)已成為一種新的結(jié)直腸癌診斷方法，在結(jié)直腸癌的早期診斷中有顯著的優(yōu)勢。</p>4、大量的研究和實(shí)踐已經(jīng)表明結(jié)直腸癌篩查和早診早治可以有效降低結(jié)直腸癌的死亡率。隨著人群結(jié)直腸癌篩查項(xiàng)目的廣泛開展，規(guī)范結(jié)直腸癌篩查與早診早治技術(shù)和實(shí)施方案對保證結(jié)直腸癌防控效果至關(guān)重要。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本公開內(nèi)容的實(shí)施方案旨在至少在一定程度上解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的至少一個(gè)問題，由此提供了下述技術(shù)方案：
2、第一方面，本專利技術(shù)提供了檢測pank3的試劑和/或裝置在制備診斷結(jié)直腸癌的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
3、優(yōu)選地，所述產(chǎn)品中還可以包含檢測其他生物標(biāo)志物的試劑/裝置，例如med11的檢測試劑/裝置。
4、在一種具體地實(shí)施例中，所述分子標(biāo)志物med11另可稱為hspc296、mediator?ofrna?polymerase?ii?transcription?subunit?11、mgc88387。其hgnc?id為32687。
5、第二方面，本專利技術(shù)提供了檢測pank3的試劑和/或裝置在制備預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
6、在一種具體地實(shí)施例中，所述分子標(biāo)志物pank3另可稱為pantothenate?kinase3、pantothenic?acid?kinase?3、ec?2.7.1.33。其hgnc?id為19365。
7、優(yōu)選地，所述結(jié)直腸癌包括結(jié)腸癌和直腸癌。
8、優(yōu)選地，所述產(chǎn)品包括試劑盒、芯片、核酸膜條。
9、優(yōu)選地，所述檢測pank3的試劑包括檢測pank3蛋白表達(dá)量和/或pank3mrna表達(dá)量的試劑。
10、優(yōu)選地，所述檢測pank3蛋白表達(dá)量的試劑包括以下方法中使用的試劑：免疫組織化學(xué)(immunohistochemistry)染色方法、蘇木精-伊紅染色法(hematoxylin-eosinstaining，簡稱he染色法)、番紅o-固綠染色、蛋白質(zhì)印跡(western?blot法)、酶聯(lián)免疫吸附測定(elisa)、放射性免疫測定(ria)、質(zhì)譜法、免疫沉淀分析法、流式細(xì)胞熒光技術(shù)和蛋白質(zhì)芯片法。
11、優(yōu)選地，所述檢測pank3?mrna表達(dá)量的試劑包括以下方法中使用到的試劑：聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pcr)、逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(rt-pcr)、轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的擴(kuò)增(tma)、連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(lcr)、鏈置換擴(kuò)增(sda)和基于核酸序列的擴(kuò)增(nasba)、滾動(dòng)循環(huán)擴(kuò)增(rca)、原位雜交(ish)、微陣列、southern印跡、northern印跡、高通量測序平臺方法。
12、優(yōu)選地，所述檢測裝置包括pcr儀、高通量測序平臺、檢測芯片和芯片信號讀取器。
13、優(yōu)選地，所述預(yù)后的指標(biāo)包括客觀緩解率(objective?response?rate，orr)、總生存期(overall?survival?rate，overall?survival，os)、無進(jìn)展生存期(progression-freesurvival，pfs)、疾病特異生存期(disease-free?survival，dss)、疾病進(jìn)展時(shí)間(time?toprogress，ttp)、無病生存期(disease-free?survival，dfs)、治療失敗時(shí)間(time?totreatment?failure，ttf)、應(yīng)答率(response?rate,rr)、完全應(yīng)答(complete?response,cr)、部分應(yīng)答(partial?response,pr)。
14、更優(yōu)選地，所述預(yù)后的指標(biāo)包括總生存期、無進(jìn)展生存期、疾病特異生存期。
15、如本專利技術(shù)所述，總生存期是指從隨機(jī)化開始至因任何原因引起死亡的時(shí)間；無進(jìn)展生存期是指腫瘤疾病患者從接受治療開始，到觀察到疾病進(jìn)展或者發(fā)生因?yàn)槿魏卧虻乃劳鲋g的這段時(shí)間；疾病特異性生存期是指腫瘤疾病患者從接受治療開始，到發(fā)生由特定疾病導(dǎo)致的死亡的這段時(shí)間。
16、優(yōu)選地，所述檢測是針對來自受試者的樣品進(jìn)行檢測。
17、本專利技術(shù)所述樣品是指獲得自或衍生自受試者(或待測者)的組合物，其包含有待根據(jù)例如物理，生化，化學(xué)和/或生理特點(diǎn)來表征和/或鑒定的細(xì)胞和/或其它分子實(shí)體。具體地，所述樣品包括但不限于，組織(例如腫瘤組織)，原代或培養(yǎng)的細(xì)胞或細(xì)胞系，細(xì)胞上清，細(xì)胞裂解物，血小板，血清，血漿，玻璃體液，淋巴液，滑液，濾泡液，精液，羊水，乳，全血，血液衍生的細(xì)胞，尿液，腦脊髓液，唾液，痰，淚，汗液，粘液，腫瘤裂解物，和組織培養(yǎng)液，組織提取物及其組合。
18、優(yōu)選地，所述樣品是組織。更具體地，活檢組織。
19、在本專利技術(shù)中，所述核酸膜條包括基底和固定于所述基底上的寡核苷酸探針；所述基底可以是任何適于固定寡核苷酸探針的基底，例如尼龍膜、硝酸纖維素膜、聚丙烯膜、玻璃片、硅膠晶片、微縮磁珠等。
20、在本專利技術(shù)中，所述“芯片”也稱為“陣列”，指包含連接的核酸或肽探針的固體支持物。陣列通常包含按照不同的已知位置連接至基底表面的多種不同的核酸或肽探針。這些陣列，也稱為“微陣列”，通常可以利用機(jī)械合成方法或光引導(dǎo)合成方法來產(chǎn)生這些陣列，所述光引導(dǎo)合成方法合并了光刻方法和固相合成方法的組合。陣列可以包含平坦的表面，或者可以是珠子、凝膠、聚合物表面、諸如光纖的纖維、玻璃或任何其它合適的基底上的核酸或肽。
21、在本專利技術(shù)中，所述試劑盒可以包括用于檢測來源于受試本文檔來自技高網(wǎng)
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【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
1.檢測PANK3的試劑和/或裝置在制備診斷結(jié)直腸癌的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
2.檢測PANK3的試劑和/或裝置在制備預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
3.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述結(jié)直
4.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述產(chǎn)品包括試劑盒、芯片、核酸膜條。
5.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述檢測PANK3的試劑包括檢測PANK3蛋白表達(dá)量和/或PANK3?mRNA表達(dá)量的試劑；
6.如權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，所述產(chǎn)品中還包含檢測MED11的檢測試劑和/或裝置。
7.如權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，所述預(yù)后的指標(biāo)包括客觀緩解率、總生存期、無進(jìn)展生存期、疾病特異生存期、疾病進(jìn)展時(shí)間、無病生存期、治療失敗時(shí)間、應(yīng)答率、完全應(yīng)答、部分應(yīng)答；
8.一種預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后的系統(tǒng)或其在制備預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后的產(chǎn)品中的應(yīng)用，所述系統(tǒng)包括以下裝置：
9.如權(quán)利要求8所述的系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括以下裝置：
10.一種計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)或其應(yīng)用或其在制備診斷結(jié)直腸癌或預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后的產(chǎn)品中的應(yīng)用，所述計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)上記載或運(yùn)行以下至少一種方法：
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【技術(shù)特征摘要】
1.檢測pank3的試劑和/或裝置在制備診斷結(jié)直腸癌的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
2.檢測pank3的試劑和/或裝置在制備預(yù)測結(jié)直腸癌患者預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
3.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述結(jié)直
4.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述產(chǎn)品包括試劑盒、芯片、核酸膜條。
5.如權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用，所述檢測pank3的試劑包括檢測pank3蛋白表達(dá)量和/或pank3?mrna表達(dá)量的試劑；
6.如權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，所述產(chǎn)品中還包含檢測med11的檢測試劑和/...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：楊敏，侯玉芳，李鐵鋼，閆征，周明瑄，張芳，張日新，甘文強(qiáng)，呂思霖，楊柳，
申請(專利權(quán))人：中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所，
類型：發(fā)明
國別省市：
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