肺癌生物標記及其用途制造技術(shù)

本發(fā)明專利技術(shù)包括檢測和診斷肺癌的生物標記、方法、裝置、試劑、系統(tǒng)和試劑盒。在一方面，本發(fā)明專利技術(shù)提供了生物標記，其可以單獨使用或以各種組合使用來診斷肺癌或允許區(qū)分診斷肺小結(jié)為良性或惡性的。在另一方面，本發(fā)明專利技術(shù)提供了診斷個體的肺癌的方法，其中所述方法包括在來自個體的生物學樣品中檢測至少一個生物標記值，所述至少一個生物標記值對應于選自表１第２列提供的生物標記的組的至少一個生物標記，其中基于所述至少一個生物標記值，所述個體分類為患有肺癌，或者確定所述個體患有肺癌的似然性。

【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
【國外來華專利技術(shù)】
本申請一般地涉及個體中生物標記的檢測及癌癥的診斷，更具體地涉及用于診斷個體的癌癥，更特別是肺癌的一種或多種生物標記、方法、裝置、試劑、系統(tǒng)和試劑盒。
技術(shù)介紹
下面的描述提供了本申請相關(guān)信息的概述，并非承認本文提供的信息或者引用的出版物是本申請的現(xiàn)有技術(shù)。更多的人死于肺癌而非其他癌癥類型。這對于男性和女性都是如此。2005年在美國(目前有統(tǒng)計數(shù)字的最近年份)，肺癌死亡比乳腺癌、前列腺癌和結(jié)腸癌死亡的組合還多。在那一年，107，416名男性和89，271名女性診斷患有肺癌，并且90，139名男性和 69，078女性死于肺癌。在美國男性中，肺癌是白人男性、黑人男性、亞裔/太平洋島男性、美國印第安男性/阿拉斯加土著男性以及西班牙裔男性中第二常見的癌癥。在美國女性中， 肺癌是白人女性、黑人女性、美國印第安女性/阿拉斯加土著女性中第二常見的癌癥，并且是亞裔/太平洋島女性和西班牙裔女性中第三常見的癌癥。對于不戒煙的人，肺癌死亡率為15%，甚至對于50-59歲的戒煙的人仍為5%以上。僅美國在肺癌上每年保健費用就為 950億美元。91%由吸煙所致的肺癌是非小細胞肺癌(NSCLC)，其占所有肺癌的約87%。所有肺癌中剩余的13%是小細胞肺癌，雖然混合細胞肺癌確有發(fā)生。因為小細胞肺癌罕見且迅速致死，所以早期檢測機會不大。NSCLC有三種主要類型鱗狀細胞癌、大細胞癌和腺癌。腺癌是最常見形式的肺癌 (30% _40%，且據(jù)報道高達50% )，并且是在吸煙者和非吸煙者中最常發(fā)現(xiàn)的肺癌。鱗狀細胞癌占所有肺癌的25-30%，并且通常在近端支氣管中發(fā)現(xiàn)。早期NSCLC傾向于局部化， 如果早期檢測到，其通常可以手術(shù)治療，并且結(jié)果有利且存活率改善。其他治療選擇包括放療、藥物療法和這些方法的組合。NSCLC根據(jù)腫瘤大小及其在包括淋巴結(jié)在內(nèi)的其他組織中的存在來分期。在隱藏期，癌細胞在痰樣品或灌洗樣品中發(fā)現(xiàn)，在肺中檢測不到腫瘤。在0期，僅肺最深的內(nèi)襯 (lining)表現(xiàn)出癌細胞，腫瘤沒有生長通過內(nèi)襯。在IA期，癌癥被認為是侵襲性的，并且已生長深入肺組織，但是腫瘤橫向(across)小于3cm。在這個時期，在支氣管或淋巴結(jié)中未發(fā)現(xiàn)腫瘤。在IB期，腫瘤橫向大于3cm或者已生長入支氣管或胸膜，但是尚未生長入淋巴結(jié)。 在IIA期，腫瘤橫向大于3cm，并且已生長入淋巴結(jié)。在IIB期，腫瘤在淋巴結(jié)中發(fā)現(xiàn)并且橫向大于3cm，或者已生長入支氣管或胸膜；或者癌癥不在淋巴結(jié)中但是在胸壁、膈、胸膜、支氣管或圍繞心臟的組織中發(fā)現(xiàn)。在IIIA期，癌細胞在肺和支氣管附近的淋巴結(jié)中以及肺之間的淋巴結(jié)中，不在在腫瘤所位于的胸的一側(cè)上。在IIIB期，癌細胞位于胸的腫瘤的對側(cè)及在頸中。肺附近的其他器官也可以具有癌細胞，并且在一個肺葉中可以發(fā)現(xiàn)多個腫瘤。在 IV期，腫瘤在相同肺或兩個肺多于一個的肺葉中發(fā)現(xiàn)，并且癌細胞在身體其他部分發(fā)現(xiàn)。目前肺癌診斷方法包括測試痰的癌細胞、胸部X-射線、呼吸道的纖維光學評價和低劑量螺旋計算機斷層掃描(CT)。痰細胞學的靈敏性非常低。胸X-射線也較不靈敏，而且要求病灶的大小大于Icrn以可見。支氣管鏡檢查要求腫瘤在支氣管鏡可及的呼吸道內(nèi)可見。最廣泛認可的診斷方法是CT，但是常與X-射線一起，CT的應用涉及電離輻射，其本身可以導致癌癥。CT還有明顯的限制掃描需要高技術(shù)水平以解釋，并且許多觀測的異常事實上不是肺癌，在跟蹤CT發(fā)現(xiàn)中產(chǎn)生很大保健花費。最常見伴隨發(fā)現(xiàn)是良性肺小結(jié)。肺小結(jié)是較圓的病灶或異常組織區(qū)域，其位于肺中且大小可變。肺小結(jié)可以是良性或癌性的，但是大多數(shù)是良性的。如果小結(jié)小于4mm，則發(fā)病率僅為1.5%，如果小結(jié)為 4_8mm，則發(fā)病率為約6%，如果超過20mm，則發(fā)病率為約20%。對于小和中等大小的小結(jié)， 建議患者在3個月至1年內(nèi)重復掃描。對于許多大小結(jié)，患者接受生物活檢(其是侵入性的并且可能導致并發(fā)癥)，即使大部分小結(jié)是良性的。因此，亟需可以替代或補充CT的診斷方法以減少進行的手術(shù)數(shù)量及降低手術(shù)并發(fā)癥的風險。另外，甚至當不存在或未知肺小結(jié)時，需要在早期檢測肺癌的方法以改善患者的結(jié)局。僅16%的肺癌病例診斷為局部早期癌癥，其中5年存活率為46%，相比之下，在晚期診斷的為84%，其中5年存活率僅為13%。這證實依賴于癥狀診斷是無用的，因為它們中的許多是其他肺疾病常見的。這些癥狀包括久咳、血痰、胸痛和復發(fā)性支氣管炎或肺炎。當存在癌癥早期診斷方法時，益處通常是醫(yī)療行業(yè)所接受的。廣泛使用篩查方案的癌癥具有最高5年的存活率，如乳腺癌(88% )和結(jié)腸癌(65% )，相比之下肺癌為16%。 但是，如果癌癥在1期通過篩查診斷，則88%的肺癌患者存活10年或更長。這證實明顯亟需可以可靠地檢測早期NSCLC的診斷方法。特定疾病狀態(tài)的生物標記的選擇首先涉及鑒定標記，該標記對特定醫(yī)療應用在疾病群體中具有與對照群體相比可測量且統(tǒng)計學顯著的差異。生物標記可以包括分泌或脫落 (shed)的分子，其與疾病發(fā)展或進程平行，并且容易從肺組織或遠端組織對病灶響應而擴散入血流。鑒定的生物標記或生物標記的集合(set)通常臨床上進行驗證，或者證實為對其所選的原始預期用途是可靠的指示物。生物標記可以包括小分子、肽、蛋白和核酸。影響生物標記鑒定的一些關(guān)鍵問題包括可用數(shù)據(jù)的過擬合(over-fitting)及數(shù)據(jù)偏差。已使用各種方法來試圖鑒定生物標記及診斷疾病。對于基于蛋白的標記，這些方法包括二維電泳、質(zhì)譜和免疫測定方法。對于核酸標記，這些方法包括mRNA表達譜、微RNA 譜、FISH、基因表達系列分析(SAGE)和大規(guī)?；虮磉_陣列。二維電泳的應用由于如下問題而受限低檢測靈敏度；與蛋白溶解性、電荷及疏水性相關(guān)的問題；凝膠再現(xiàn)性；以及單個斑點代表多個蛋白的可能性。對于質(zhì)譜，取決于所用形式，限制圍繞樣品加工和分離、對低豐度蛋白的靈敏性、信噪比考慮及不能立即鑒定檢測的蛋白而出現(xiàn)。免疫測定方法發(fā)現(xiàn)生物標記的限制集中在基于抗體的多重測定不能測量大量分析物?？梢院唵蔚赜∷⒏哔|(zhì)量抗體的陣列，并且無需夾心而測量與這些抗體結(jié)合的分析物。(這會使用全基因組核酸序列經(jīng)雜交測量有機體或細胞中的全部DNA或RNA序列的方式上的等同物。因為雜交可以是同一性的嚴緊測試，所以雜交實驗可行。甚至非常好的抗體在選擇它們的結(jié)合配偶體中也并非足夠嚴緊來在血液或甚至是細胞提取物環(huán)境中工作，因為那些基質(zhì)中的蛋白總體(ensemble)具有極其不同的豐度。)因此，必須使用不同的基于免疫測定的方法以發(fā)現(xiàn)生物標記一需要使用多重ELISA測定(即夾心)以獲得足夠嚴緊性來同時測量許多分析物從而決定哪些分析物確實是生物標記。夾心免疫測定不放大到高含量，因此使用標準陣列形式不能用嚴緊夾心免疫測定發(fā)現(xiàn)生物標記。最后，抗體試劑容易產(chǎn)生相當大的批次差異和試劑不穩(wěn)定性。本專利技術(shù)的蛋白生物標記發(fā)現(xiàn)平臺克服了這個問題。許多這些方法依賴或需要在分析前一些類型的樣品的分級。因此進行設計為在一系列良好限定的樣品群體中鑒定/發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學相關(guān)生物標記的足夠有效的研究所需樣品制備是極其困難、昂貴和耗時的。在分級期間，大范圍的各種變異性可能被引入各種樣品。 例如，一個潛在的標記可能對于方法是不穩(wěn)定的，標記的濃度可能變化，不合適的聚集或解聚可能發(fā)生，本文檔來自技高網(wǎng)...

【技術(shù)保護點】
１．一種診斷個體患有或不患有肺癌的方法，所述方法包括：在來自個體的生物學樣品中檢測生物標記值，所述生物標記值每個對應于選自表１的至少Ｎ個生物標記之一，其中所述個體基于所述生物標記值分類為患有或不患有肺癌，其中Ｎ＝２－６１。

【技術(shù)特征摘要】
【國外來華專利技術(shù)】...

【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：L·戈爾德，
申請(專利權(quán))人：私募蛋白質(zhì)體公司，
類型：發(fā)明
國別省市：US