一種SLCO1B1基因多態性檢測特異性引物和液相芯片制造技術

本發明專利技術公開了一種SLCO1B1基因多態性檢測特異性引物和液相芯片，該液相芯片主要包括有：每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態性位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為：針對T130C位點的SEQ?ID?NO.13和SEQ?ID?NO.14；針對T127C位點的SEQ?ID?NO.15和SEQ?ID?NO.16；針對T56C位點的SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18；針對G107C位點的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20；針對A96T位點的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22；和/或針對A132G位點的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本發明專利技術所提供的檢測液相芯片的檢測結果與測序法的吻合率高達100％，實現多個多態性位點的野生型和突變型并行檢測。

【技術實現步驟摘要】

本專利技術屬于分子生物學領域，涉及醫學和生物技術，具體的是涉及一種SLC01B1基因多態性檢測特異性引物和液相芯片。
技術介紹
有機陰離子轉運多肽0ATP1B1 (又稱OA TP-C，0ATP2，LS Tl，編碼基因SLC01B1)是一種特異性分布于肝細胞基底膜上的一種轉運蛋白，和體內諸多內源性或外源性物質的肝臟攝取作用關系密切。近年來，SLC01B1基因上已陸續發現多個單核苷酸多態性(SNP)，其中有些SNP已經在體外或體內實驗中證實與轉運功能異常有關。目前，對SIX01B1基因多態性進行檢測和分析的方法很少，主要是PCR-RFLP分析法，PCR-RFLP法是基于基因突變造成的限制性內切酶識別位點的改變，如位點丟失或產生新位點，通過PCR擴增某一特定片段，再用限制性內切酶酶切擴增產物，電泳觀察片段的大小，這種方法用于檢測酶切位點改變的基因突變，可直接判斷基因型，但該法不能用于沒有產生新酶切位點的基因突變檢測。再次，PCR-RFLP分析法存在著檢測通量的局限性，每次只能檢測一種突變類型，不能滿足實際應用的需要。本專利技術目標檢測的SLC01B1基因突變位點(多態性位點)，如表所示權利要求1.一種SLC01B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，包括有 (A).針對SLC01B1基因不同多態性位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態性位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為:針對T130C位點的SEQ ID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;針對T127C位點的 SEQ ID NO. 15 和 SEQ ID NO. 16 ;針對 T56C 位點的 SEQ ID NO. 17 和 SEQ ID NO. 18 ;針對G107C位點的 SEQ ID NO. 19 和 SEQ ID NO. 20 ;針對A96T位點的 SEQ ID NO. 21 和 SEQ IDNO. 22 ;和/或針對A132G位點的SEQ ID NO. 23和SEQ ID NO. 24 ;所述tag序列選自SEQID NO. I SEQ ID NO. 12 (B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對； (C).用于擴增出需要檢測的、具有相應多態性位點的目標序列的引物。2.根據權利要求I所述的SLC01B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，所述擴增引物為針對 T130C 位點的 SEQ ID NO. 37 和 SEQ ID NO. 38 ;針對 T127C 位點的 SEQ ID NO. 39 和SEQ ID NO. 40 ;針對T56C位點的 SEQ ID NO. 41 和 SEQ ID NO. 42 ;針對G107C位點的 SEQ IDNO. 43 和 SEQ ID NO. 44 ;和 / 或針對 A96T、A132G 位點的 SEQ ID NO. 45 和 SEQ ID NO. 46。3.根據權利要求I所述的SLC01B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE引物為針對T130C位點的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 13組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 14組成的序列；針對T127C位點的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 16組成的序列；針對T56C位點的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 17組成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18組成的序列；針對G107C位點的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19組成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20組成的序列；針對A96T位點的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21組成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID NO. 22組成的序列；和/或針對A132G位點的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23組成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24組成的序列。4.根據權利要求I所述的SLC01B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是， (A).所述ASPE引物為針對T130C位點的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 13組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 14組成的序列；針對T127C位點的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 16組成的序列；針對T56C位點的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 17組成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18組成的序列;針對G107C位點的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19組成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20組成的序列；針對A96T位點的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21組成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQID NO. 22組成的序列；和針對A132G位點的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23組成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24組成的序列； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對； (C).所述擴增引物為:針對T130C位點的SEQID NO. 37和SEQ ID NO. 38 ;針對T127C位點的 SEQ ID NO. 39 和 SEQ ID NO. 40 ;針對 T56C 位點的 SEQ ID NO. 41 和 SEQ ID NO. 42 ；針對G107C位點的SEQ ID NO. 43和SEQ ID NO. 44 ;和針對A96T、A132G位點的SEQ ID NO. 45和 SEQ ID NO. 46。5.根據權利要求1-4任一項所述的SLC01B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。6.用于SLC01B1基因多態性檢測的特異性引物，其特征是，所述特異性引物序列為針對T130C位點的SEQ ID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;針對T127C位點的SEQ ID NO. 15和SEQ IDNO. 16 ;針對 T56C位點的 SEQ ID NO. 17 和 SEQ ID NO. 18 ;針對G107C位點的 SEQ ID NO. 19和 SEQ ID NO. 20 ;針對 A96T 位點的 SEQ ID NO.本文檔來自技高網...

【技術保護點】
一種SLCO1B1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，包括有：(A).針對SLCO1B1基因不同多態性位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態性位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為：針對T130C位點的SEQ?ID?NO.13和SEQ?ID?NO.14；針對T127C位點的SEQ?ID?NO.15和SEQ?ID?NO.16；針對T56C位點的SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18；針對G107C位點的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20；針對A96T位點的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22；和/或針對A132G位點的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.12：(B).有anti?tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti?tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti?tag序列選自SEQ?ID?NO.25～SEQ?ID?NO.36，且所述anti?tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應多態性位點的目標序列的引物。...

【技術特征摘要】

【專利技術屬性】
技術研發人員：許嘉森，郭靖，
申請(專利權)人：廣州益善生物技術有限公司，
類型：發明
國別省市：