一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法技術(shù)

本發(fā)明專利技術(shù)公開了一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法，涉及SNP分子標(biāo)記育種領(lǐng)域，本發(fā)明專利技術(shù)的技術(shù)方案包括如下步驟：S1，以待檢測(cè)鵝的全基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到參考基因組序列，結(jié)合待檢測(cè)鵝肉pH值數(shù)據(jù)，通過全基因組關(guān)聯(lián)分析，篩選獲得待測(cè)鵝肉pH值的候選的SNP位點(diǎn)；S2，利用飛行質(zhì)譜的技術(shù)檢驗(yàn)SNP位點(diǎn)在鵝個(gè)體中的分布頻率，并與鵝肉pH值性狀做關(guān)聯(lián)分析。鑒定的SNPs可鵝肉品質(zhì)篩選提供理論支持，為鵝肉品質(zhì)改良、育種提供重要參考，為開發(fā)育種標(biāo)記提供新的方向。

【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】

本專利技術(shù)涉及snp分子標(biāo)記育種領(lǐng)域，特別是涉及一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)ph值的snp分子標(biāo)記方法。

技術(shù)介紹

1、鵝肉雖然僅占全球家禽生產(chǎn)的2％，但由于其高蛋白質(zhì)含量、理想的氨基酸組成、低脂肪和低膽固醇水平以及高不飽和脂肪酸，被認(rèn)為是飲食多樣性和營(yíng)養(yǎng)安全的重要保障。這些品質(zhì)得到了世界衛(wèi)生組織的認(rèn)可，使得鵝肉成為一種重要的營(yíng)養(yǎng)食物來源，并對(duì)全球食品安全和優(yōu)化營(yíng)養(yǎng)作出重要貢獻(xiàn)。

2、鵝肉質(zhì)量的好壞是由鵝肉品質(zhì)性狀決定，而鵝肉品質(zhì)性狀受到品種差異、屠宰方式和育種改良不均衡等多種因素的綜合影響。其中，周圍環(huán)境是影響鵝肉品質(zhì)性狀的關(guān)鍵因素，再加上統(tǒng)計(jì)鵝肉品質(zhì)性狀需要收集足夠多的個(gè)體，需要耗費(fèi)大量的人力資源和時(shí)間成本，效率低下，結(jié)果不盡人意。

3、ph值是影響鵝肉品質(zhì)的重要因素之一，被廣泛應(yīng)用于評(píng)估鵝肉質(zhì)性狀的數(shù)量性狀。ph值的選擇也受到品種、屠宰方式、宰后處理、生理狀態(tài)等多種因素的共同影響。由于ph值受多種因素的共同調(diào)控，且表型統(tǒng)計(jì)難度較大，因此亟需一種便捷、高效且準(zhǔn)確性高的生物學(xué)手段，以推動(dòng)鵝肉品種的選育工作。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、為解決上述技術(shù)問題，本專利技術(shù)提供了一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)ph值的snp分子標(biāo)記方法。鑒定的snps可鵝肉品質(zhì)篩選提供理論支持，為鵝肉品質(zhì)改良、育種提供重要參考，為開發(fā)育種標(biāo)記提供新的方向。

2、本專利技術(shù)解決其技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案是：一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)ph值的snp分子標(biāo)記方法包括如下步驟：

3、s1，以待檢測(cè)鵝的全基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到參考基因組序列，結(jié)合待檢測(cè)鵝肉ph值數(shù)據(jù)，通過全基因組關(guān)聯(lián)分析，篩選獲得待測(cè)鵝肉ph值的候選的snp位點(diǎn)；

4、s2，利用飛行質(zhì)譜的技術(shù)檢驗(yàn)snp位點(diǎn)在鵝個(gè)體中的分布頻率，并與鵝肉ph值性狀做關(guān)聯(lián)分析。

5、優(yōu)選地，30個(gè)snp位點(diǎn)包括如下：

6、chr13:31574342、chr17:23566904、chr17:23566877、chr5:29563347、chr13:31574379和chr13:31599541；

7、9個(gè)snp包括如下：chr37:5044859、chr17:23683245、chr21:2614659、chr15:1248686、chr8:31941519、chr5:29563347、chr13:31599746、chr17:23566904、chr21:2584087。

8、優(yōu)選地，檢測(cè)9個(gè)snp分子標(biāo)記引物對(duì)為：

9、

10、優(yōu)選地，ph值顯著相關(guān)的snps的基因型如下：

11、

12、

13、本專利技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)：

14、本專利技術(shù)利用分子標(biāo)記的方法對(duì)鵝肉品質(zhì)較高的公鵝進(jìn)行選育，在雛鵝一直到70日齡階段快速準(zhǔn)確地篩選出具有目標(biāo)性狀的個(gè)體，從而大幅提升選育效率。發(fā)現(xiàn)與鵝肉質(zhì)ph值的30個(gè)snp位點(diǎn)，利用飛行質(zhì)譜方法開展驗(yàn)證，本方案鑒定的snps可鵝肉品質(zhì)篩選提供理論支持，為鵝肉品質(zhì)改良、育種提供重要參考，為開發(fā)育種標(biāo)記提供新的方向，還可以顯著推進(jìn)分子育種工作，具有重要的理論和商業(yè)價(jià)值。

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【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

1.一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法，其特征在于，包括如下步驟：

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法，其特征在于：

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法，其特征在于：檢測(cè)9個(gè)SNP分子標(biāo)記引物對(duì)為：

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)pH值的SNP分子標(biāo)記方法，其特征在于：pH值顯著相關(guān)的SNPs的基因型如下：

【技術(shù)特征摘要】

1.一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)ph值的snp分子標(biāo)記方法，其特征在于，包括如下步驟：

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于檢測(cè)鵝肉質(zhì)ph值的snp分子標(biāo)記方法，其特征在于：

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于...

【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：高廣亮，王啟貴，張克山，趙獻(xiàn)芝，王麗輝，馬琳，吳一凡，柳怡，吳睿，薛佳佳，羅藝，陳英，王海威，汪超，許國(guó)洋，付文貴，翟少欽，許愿，阿國(guó)達(dá)，宋彤彤，劉涵宇，蔣新帥，
申請(qǐng)(專利權(quán))人：重慶市畜牧科學(xué)院，
類型：發(fā)明
國(guó)別省市：