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    基于黑麥EST序列的黑麥1R~7R染色體特異的分子標記及其應(yīng)用制造技術(shù)

    技術(shù)編號:6528643 閱讀:366 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
    本發(fā)明專利技術(shù)公開了14個基于黑麥EST序列的黑麥1R~7R染色體特異的分子標記,這些分子標記為根據(jù)黑麥染色體上的表達序列標簽(expressedsequencetag,EST)序列而設(shè)計的正向引物和反向引物,這些分子標記為用于鑒定黑麥1R~7R染色體的特異標記;應(yīng)用這些分子標記對黑麥1R~7R染色體進行鑒定的基本步驟包括:A、標記引物的選定和制備;B、標記引物的稀釋;C、黑麥染色體的特異標記:C-1、模板DNA的提取;C-2、PCR擴增;C-3、擴增產(chǎn)物的檢測;C-4、結(jié)果比對。本發(fā)明專利技術(shù)基于黑麥染色體上的EST序列設(shè)計開發(fā)出了一套黑麥染色體的特異分子標記,借助這些分子標記能夠用普通PCR技術(shù)快速、準確的鑒定小麥遺傳背景中的1R~7R全部黑麥染色體,為黑麥染色體上有益基因轉(zhuǎn)移到栽培小麥背景中提供了簡便有效的分子鑒定方法。

    【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】

    本專利技術(shù)涉及分子生物學(xué)和遺傳育種領(lǐng)域,具體涉及基于黑麥表達序列標簽 (expressed sequence tag, EST)序列設(shè)計的分子標記,以及這些分子標記在跟蹤檢測黑麥染色體方面的應(yīng)用。
    技術(shù)介紹
    小麥的近緣種黑麥cereale L.)具有許多優(yōu)良的性狀,如根系發(fā)達、分蘗強、抗旱、耐瘠薄、耐寒、耐鹽堿和酸性土壤,尤其是抗多種病害,如小麥白粉病 graminis f. sp. tri tici ) > ^r M iPuccinia graminis f. sp. triiici )、口十繡病(/· triticina Eriks.)、禾干繡病(/· graminis Pers. f. sp. triiici )、月星黑種病(Tilletia Controversa Kuhn, TCK)和大麥黃矮病(Barley yellow dwarf virus, BYDV)等。因此,黑麥是對小麥進行遺傳改良,拓寬小麥遺傳基礎(chǔ),增加小麥栽培品種遺傳變異的重要基因源。黑麥優(yōu)異基因向小麥中轉(zhuǎn)移的途徑主要是創(chuàng)制一系列小麥/黑麥雙二倍體、附加系、代換系和易位系。通過遠緣雜交和染色體工程等手段將黑麥染色體導(dǎo)入到小麥背景中,之后,還需要對其進行準確的鑒定,才能有效地加以利用。與細胞學(xué)技術(shù)和生化標記法相比,分子標記法簡單、快速和準確的特點使其廣泛地用于檢測、跟蹤導(dǎo)入小麥背景中的黑麥染色體。然而,目前開發(fā)的黑麥染色體的特異標記,多集中在黑麥的IRS染色體上,如 SSRfeid Bmac0213 Φ^Χ^ Schneider A and Molnar-Lang Μ. 2008. Polymorphism analysis using IRS-specific molecular markers in rye cultivars {Secale cereale L.) of various origin. Cereal Res Commun, 36: 11_19);SSAP 標記 S10, S20, S17 (參考文獻:Nagy ED and Lelley Τ. 2003. Genetic and physical mapping of sequence specific amplified polymorphic (SSAP) markers on the IRS chromosome arm in a wheat background. Theor Appl Genet, 107: 1271_1277);EST_STS 標記 STSwe3 和 STSwel26 (參考文獻Wang CM, Li LH, Zhang XT, Gao Q, Wang RF, andAn DG. 2009. Development and application of EST-STS markers specific to chromosome IRS ofSecale cereale. Cereal Research Communications 37: 13—21)等。Zhuang 等(2008) 艮道了 1R,4R,5R 和 7R 染色體特異的 EST-SSR 標記(參考文獻Zhuang LF, Song LX, Feng YG, Qian BL, Xu HB, Pei ZY, Qi ZJ. 2008. Development and chromosome mapping of new wheat EST-SSR markers and application for characterizing rye chromosomes added in wheat. Acta Agron Sin, 34: 926-933)。Lee 等(2009)還報道了 6 個 2RL 染色體特異的 EST標記(參考文獻Lee TG, Hong MJ, Johnson JW, Bland DE, Kim DY, Seo Yff. 2009. Development and functional assessment of EST-derived 2RL-specific markers for 2BS. 2RL translocations. Theor Appl Genet, 119: 663-673)。然而,到目前為止,還沒有人報道來源于黑麥表達序列標簽(EST)序列的一套完整的黑麥IR 7R染色體特異的分子標記,以用來檢測鑒定小麥背景中的IR 7R全部黑麥染色體。
    技術(shù)實現(xiàn)思路
    本專利技術(shù)要解決的技術(shù)問題是提供一套基于黑麥EST序列的黑麥IR 7R染色體特異的分子標記,基于黑麥染色體上的EST序列設(shè)計開發(fā)出了一套黑麥染色體的特異分子標記,借助這些分子標記能夠用普通PCR技術(shù)快速、準確的鑒定小麥遺傳背景中的IR 7R全部黑麥染色體,為黑麥染色體上有益基因轉(zhuǎn)移到栽培小麥背景中提供了簡便有效的分子鑒定方法。為解決上述技術(shù)問題,本專利技術(shù)所采取的技術(shù)方案是基于黑麥EST序列的黑麥IR 7R染色體特異的分子標記,這些分子標記為根據(jù)黑麥染色體上的EST序列而設(shè)計的正向引物和反向引物,這些分子標記為用于鑒定黑麥IR 7R 染色體的特異標記,其堿基序列見表1,表1.根據(jù)黑麥染色體上的EST序列設(shè)計的14對標記引物序列本文檔來自技高網(wǎng)
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    【技術(shù)保護點】
    1.基于黑麥EST序列的黑麥1R~7R染色體特異的分子標記,其特征在于:這些分子標記為根據(jù)黑麥染色體上的表達序列標簽EST序列設(shè)計的正向引物和反向引物,這些分子標記為用于鑒定黑麥1R~7R染色體的特異標記,其堿基序列見表1,表1. 根據(jù)黑麥染色體上的表達序列標簽EST序列設(shè)計的14對標記引物序列其中,1-CGG143標記用于鑒定黑麥1R和6R染色體;2-CGG62、3-CGG8和4-CGG9標記用于鑒定黑麥2R染色體;5-CGG32標記用于鑒定黑麥3R染色體;6-CGG49標記用于鑒定黑麥4R染色體;7-CGG4、8-CGG16、9-CGG18、10-CGG19和11-CGG43標記用于鑒定黑麥5R染色體;12-CGG23和13-CGG59標記用于鑒定黑麥6R染色體;14-CGG26標記用于鑒定黑麥7R染色體。

    【技術(shù)特征摘要】
    1.基于黑麥EST序列的黑麥IR 7R染色體特異的分子標記,其特征在于這些分子標記為根據(jù)黑麥染色體上的表達序列標簽EST序列設(shè)計的正向引物和反向引物,這些分子標記為用于鑒定黑麥IR 7R染色體的特異標記,其堿基序列見表1,表1.根據(jù)黑麥染色體上的表達序列標簽EST序列設(shè)計的14對標記引物序列體正向引物序列 (S' -3')反向引物 -3')1-CGG143iR, etB SBQ ID NO1 1見 SBQ ID Μ) 22-CGG622S% 觀 ID NO: 3BSEQ ID 43-CGG82R見卿ID ND: 5BSBQ ID NO: 64-CGG9 5-CGG3228 3R見測ID NO1 7 見卿ID NG1 9見卿ID NO^ δ 見 SEQ ID Nth 106-CGG49■見測 ID NOi 11ASEQ ID MOi 127 CGG45R見 SEKJ ID NO: 13見SEQ ID NO: 148-CGG16 9-CGG185R 58見卿 ID NDi 15 Λ 挪 ID NOi 17見SEQ ID NOi 16 Eseq id Noi is10-CGG1958見卿 ID NO1 19見SEQ ID NO 2011-CGG4358見卿 ID NO1 21見 SEQ ID NO 2212CGG23 13-CGG596K 6R% SFjQ ID 23 JL SBQ ID NO 25B SfiQ ID Wt Α 見SEQ ID NOt 2614-CGG267BE 測 ID NO: 27JiSEQ ID NO^ 28其中,1-CGG143標記用于鑒定黑麥IR和6R染色體;2_CGG62、3_CGG8和4-CGG9標記用于鑒定黑麥2R染色體;5-CGG32標記用于鑒定黑麥3R染色體;6-CGG49標記用于鑒定黑麥 4R染色體;7-CGG4、8-CGG16、9-CGG18、10-CGG19和11-CGG43標記用于鑒定黑麥5R染色體; 12-CGG23和13-CGG59標記用于鑒定黑麥6R染色體;14_CGG^標記用于鑒定黑麥7R染色體。2.應(yīng)用權(quán)力要求1所述的基于黑麥EST序列的黑麥IR 7R染色體特異的分子標記對小麥背景中黑麥染色體進行鑒定的方法,其特征步驟包括A、分子標記的選定和制備根據(jù)所需鑒定的黑麥染色體選定分子標記,比如,預(yù)備檢測鑒定的小麥與黑麥遠緣雜交后代材料當中是否含有黑麥4R染色體,則選定6-CGG49分子標記,然后根據(jù)權(quán)利要求1給出的序列合成此標記引物;B、標記引物的稀釋將上步合成的標記引物,先用IXTE緩沖液溶解成IOOmmolL—1的母液放入-20°C的冰箱中保存,使用前吸取母液用超純水稀釋成IOmmol L—1的工作液待用; 其中 IXTE 緩沖液的配方為,IOmmol Γ1 Tris-HCl 與 l...

    【專利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:安調(diào)過尹冬冬許紅星李立會
    申請(專利權(quán))人:中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所
    類型:發(fā)明
    國別省市:13

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