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    質量標記物制造技術

    技術編號:8128400 閱讀:190 留言:0更新日期:2012-12-26 23:42
    提供了一組兩種或多種質量標記物,組中各質量標記物包含通過可斷裂的連接物連接于質量歸一化部分的質量指示部分,該質量指示部分具有抗碎裂性,其中,組中各標記物的聚集質量可以相同或不同,組中各標記物的質量指示部分的質量可相同或不同,其中,在組中具有共同質量的質量指示部分的標記物的任何組合中,各標記物具有與該組合中的所有其它標記物不同的聚集質量,并且,在組中具有共同的聚集質量的標記物的任何組合中,各標記物具有其質量不同于該組合中所有其它質量指示部分的質量的質量指示部分,這樣組中所有的質量標記物可由質譜法得以相互區分。(*該技術在2021年保護過期,可自由使用*)

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術涉及用于標記分析物(具體是生物分子如核酸和蛋白質)的有用的化合物。具體而言,本專利技術涉及采用質譜法使用特殊的質量標記物進行分析的方法。
    技術介紹
    標記感興趣的分子的各種方法在本領域中是已知的,包括放射性原子、熒光染料、發光試劑、電子俘獲劑和光吸收染料。這些標記系統的每ー種都具有使其適合于某些應用而非其它應用的特征。由于安全原因,對非放射性標記系統的興趣已導致熒光標記方案的 廣泛的商業發展,尤其是用于遺傳分析的熒光標記。熒光標記方案使得相對少量的分子能同時進行標記,通常可同時使用4種標記物,也可能達到8種。但是,檢測裝置的成本和分析所產生的信號的難度限制了可在熒光檢測方案中同時使用的標記物的數量。最近,在質譜法領域中已開發了一種檢測可斷裂地連接于它們相關的感興趣分子的標記物的方法。在許多分子生物學應用中,人們需要能在分析之前分離出感興趣的分子。通常進行液相分離。近年來,質譜法已發展了許多用于液相分離的界面,這使得質譜法可特別有效地用作這些應用的檢測系統。直到最近才采用液相色譜質譜法直接檢測分析物離子或它們的片段離子。但是,對于許多應用,如核酸分析,分析物的結構可從間接的標記而得以確定。這尤其對于采用質譜法是有利的,因為復雜的生物分子(如DNA)具有復雜的質譜,并且其檢測具有相對差的敏感性。間接檢測指可使用相關的標記物分子來鑒別原始的分析物,該標記物被設計用于敏感性檢測,并具有簡單的質譜。簡單的質譜使得可同時使用多種標記物分析大量的分析物。PCT/GB98/00127描述了共價連接于可斷裂的標記物的核酸探針的陣列,所述標記物可采用質譜法檢測到,該方法可鑒別共價連接的核酸探針的序列。此申請中的標記的探針具有Nu-L-M的結構,其中Nu是共價連接于L的核酸,L是可斷裂的連接物,它共價連接于M,M是質量標記物。在此應用中,較佳的可斷裂的連接物在質譜儀的離子源中斷裂。此申請公開了多種離子化方法和使用四極質量分析儀、飛行時間(Time of flight,T0F)分析儀和磁性扇形場儀器進行的分析,將它們作為采用質譜法分析質量標記物的特殊方法。PCT/GB94/01675公開了可斷裂地連接于質量標記分子的配體和特殊的核酸。較佳的可斷裂連接物是光可斷裂的。此申請公開了基質輔助的激光解吸電離(MALDI)TOF質譜法作為采用質譜法分析質量標記物的特殊方法。PCT/US97/22639公開了可釋放的非揮發性質量標記物分子。在優選的實施方式中,這些標記物含有聚合物,通常是生物聚合物,這些聚合物可斷裂地連接于反應性基團或配體(即探針)。優選的可斷裂的連接物似乎在化學上和酶學上是可斷裂的。此申請公開了 MALDI TOF質譜法作為采用質譜法分析質量標記物的特殊方法。PCT/US97/01070、PCT/US97/01046 和 PCT/US97/01304 公開了可斷裂地連接于質量標記分子的配體和特殊的核酸。較佳的可斷裂的連接物似乎是化學可斷裂的或光可斷裂的。這些申請公開了許多離子 化方法和使用四極質量分析儀、TOF分析儀和扇形磁場儀器進行的分析,將它們作為采用質譜法分析質量標記物的特殊方法。分析物材料所產生的質譜對污染物非常敏感。基本上,可電離的導入質譜儀中的任何材料都將出現在質譜中。這意味著對于許多分析,需要在將分析物導入質譜儀前進行小心地純化。對于高通量系統,為了通過使用質量標記物對分析物進行間接分析的目的,需要避免任何不需的樣品制備步驟。即,需要能檢測污染材料背景中的標記物,并能確定所檢測到的峰事實上與標記物相符。現有的技術沒有公開在以檢測系統為基礎的質譜法中改進信噪比的方法或組合物,或者可提供證明譜中由質量標記物的存在引起的質量峰的方法或組合物。為了在液相層析或電泳分離后檢測分析物,需要使所使用的標記物對分離過程產生的干擾最小。如果使用這類分析物的陣列,則需要陣列中的各個成員對與它們連相關的分析物的影響與其它標記物相同。這在某種程度上與質量標記的意圖有抵觸,這種意圖產生基于其質量在質譜儀中可分解的標記物陣列。質量標記物較佳應可被分解成4道爾頓,以防止一種標記物的同位素峰受到其它標記物的同位素峰的干擾。這意味著為了產生250個不同的質量標記物,可能需要標記物的范圍擴展到約1000道爾頓,可能還更多,因為重要的是產生被4道爾頓精確分離的大陣列的標記物。這個質量范圍質量將幾乎肯定會產生對采用質譜法進行檢測的任何分離過程產生不同影響的質量標記物。這對儀器設計也有關系,因為隨著質量范圍的增加超過了質譜儀可檢測離子的范圍,儀器的成本也増加。
    技術實現思路
    因此,本專利技術的ー個目的是解決與上述現有技術相關的問題,并提供在污染背景中可檢測到的質量標記物,以及作為質量標記物的身份可被證實的標記物。此外,本專利技術的ー個目的是提供在壓縮的質量范圍內可被分解的標記物的陣列,這樣這些標記物不會對分離過程有太多干擾,以及提供在質荷比的有限范圍內檢測離子的質譜儀中可容易地被檢測到的標記物的陣列。本專利技術還有ー個目的是提供分析生物分子的方法,該方法利用本專利技術的標記物使通量、信噪比和這些檢測的敏感性最大化,具體是在遺傳分析中,更具體是用在分析蛋白質的雙向凝膠電泳中。此外,下面公開的質量標記物的設計使得為檢測質量標記物的目的而設計出ー種簡易的串聯質譜儀。第一質量分析儀僅僅需要選擇有限量的其質量相對低的離子。第二質量分析儀僅僅需要檢測少量的斷裂產物。因此,本專利技術提供一組兩個或多個質量標記物,組中的各個標記物含有通過可斷裂的連接物連接于質量歸一化部分的質量指示部分,此部分具有抗碎裂性,其中,組中各標記物的聚集質量(aggregate mass)可相同或不同,并且,組中各標記物的質量指示部分的質量可相同或不同,其中,在組中具有共同質量的質量指示部分的任何類的標記物中,各標記物具有不同于該類中所有其它標記物的聚集質量,并且,在組中具有共同聚集質量的任何類的標記物中,各標記物具有其質量不同于該類中所有其它質量指示部分的質量的質量指示部分,這樣,采用質譜法分析時組中所有的質量標記物都可互相區分。術語“質量指示部分”在本文中指采用質譜法檢測到的部分,而術語“質量歸ー化部分”在本文中指采用質譜法不一定能檢測到的部分,但是它的存在確保了質量標記物具有所需的聚集質量。組中標記物的數量并沒有特殊的限制,但條件是該組含有許多的標記物。但是,組中含有兩種以上、三種以上、四種以上或五種以上的標記物較佳。 本專利技術還提供質量標記物的陣列,該陣列含有兩組以上上述陣列標記物,其中,任ー組中各質量標記物的聚集質量與陣列中其它組中的每個質量標記物的聚集質量不同。本專利技術還提供ー種分析方法,該方法包括采用質譜法鑒別不同于分析物的質量標記物或其組合,從而檢測分析物,其中,質量標記物是上述的標記物組或其陣列中的質量標記物。 附圖說明現在,本專利技術將結合附圖僅采用舉例方式作更詳細的描述,其中圖I顯示三重四極質譜儀的示意性布局圖;圖2顯示形成本專利技術的標記物組的10個片段,包括5個質量歸ー化部分(Mtl-M4)和5個質量指示部分(XcrX4),其中,將氟原子取代基用作質量調節部分;圖3顯示本專利技術ー組5個標記物,由圖2的質量歸一化部分和質量指示部分形成;圖4顯示本專利技術ー組5個質量標記物,其中,所有的本文檔來自技高網
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    【技術保護點】
    一組兩種或多種質量標記物,組中各標記物包含通過連接物連接于質量歸一化部分的質量指示部分,所述連接物含有在質譜儀中可斷裂的基團,其中,各質量歸一化部分確保質量標記物具有所需的聚集質量,且組中各質量指示部分的質量相同,其中,組中各標記物具有與該組中的所有其它標記物不同的質量,并且,組中所有的質量標記物可通過質譜法得以相互區分。

    【技術特征摘要】
    2000.03.14 GB 0006141.61.一組兩種或多種質量標記物,組中各標記物包含通過連接物連接于質量歸一化部分的質量指示部分,所述連接物含有在質譜儀中可斷裂的基團,其中,各質量歸一化部分確保質量標記物具有所需的聚集質量,且組中各質量指示部分的質量相同,其中,組中各標記物具有與該組中的所有其它標記物不同的質量,并且,組中所有的質量標記物可通過質譜法得以相互區分。2.如權利要求I所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述組中的各質量標記物具有下述結構 M (A) y-L_X (A) z 式中,M是質量歸ー化部分,X是質量指示部分,A是質量調節部分,L是可斷裂的連接物,y和z是O或O以上的整數,y+z是I或I以上的整數。3.如權利要求2所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述質量調節部分選自 (a)位于所述質量指示部分和/或質量歸一化部分的基本結構內的同位素取代基; (b)連接于所述質量指示部分和/或質量歸一化部分的基本結構的取代基原子或基團。4.如權利要求3所述的ー組質量標記物,其特征在干,所述質量調節部分選自鹵原子取代基、甲基和2H或13C同位素取代基。5.如權利要求4所述的ー組質量標記物,其特征在干,所述質量調節部分是氟原子取代基。6.如前述權利要求中任一項所述的ー組質量標記物,其特征在于,將所述質量指示部分連接于所述質量歸ー化部分的可斷裂連接物是可通過碰撞而斷裂的連接物。7.如權利要求6所述的ー組質量標記物,其特征在干,所述可斷裂的連接物包含酰胺鍵。8.如前述權利要求中任一項所述的ー組質量標記物,其特征在干,所述質量歸ー化部分包含抗斷裂基團。9.如權利要求8所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述質量歸ー化部分包含苯基。10.如前述權利要求中任一項所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述質量指示部分包含預電離的基團。11.如權利要求10所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述質量指示部分包含N-甲基批淀基,或包含選自以下的基團_NH2、-NR2> -NR3+、-SR3+、-SO3、_P04、_P03、-CO2、12.如權利要求2-11中任一項所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述組中各標記物具有下述結構13.如權利要求12所述的ー組質量標記物,其特征在于,所述R是H,L是酰胺鍵,p=0,A是氟原子。14.一組兩種或多種探針,其特征在干,組中各探針不同,它們連接于獨特的質量標記物或質量標記物的獨特組合,所述質量標記物來自權利要求1-13中任一項所述的質量標記物組。15.如權利要求14所述的探針組,其特征在于,所述各探針連接于質量標記物的獨特組合,每種組合由該質量標記物組中每種質量標記物的存在與否得以區別,和/或由連接于該探針的各質量標記物的數量加以區別。16.如權利要求14-15中任一項所述的探針組,其特征在于,所述各探針包含生物分子。17.如權利要求16所述的探針組,其特征在于,所述生物分子選自DNA、RNA、寡核苷酸、核酸堿基、蛋白質和/或氨基酸。18.ー種分析方法,該方法包括,采用質譜法鑒別質量標記物或質量標記物的組合,從而同時檢測兩種或多種分析物,其中,所述質量標記物是權利要求1-13中任ー項所定義的質量標記物組的質量標記物。19.如權利要求18所述的方法,其特征在干,由來自質量標記物組的質量標記物的獨特組合鑒別每種分析物,各種組合由所述組中的每種標記物的存在與否而得以區別,和/或由各質量標記物的數量而加以區別。20.如權利要求18-19中任ー項所述的鑒別兩種或多種分析物的方法,其特征在于,在采用質譜法檢測質量標記物之前,先根據所述分析物的質量將它們分離。21.如權利要求20所述的方法,其特征在于,采用色譜法或電泳進行分離。22.如權利要求18-21中任一項所述的方法,其特征在于,用于檢測質量標記物的質譜儀包括一個或多個質量分析儀,這些質量分析儀能使具有特定質量或質量范圍的離子通過,以進行檢測,和/或能使離子分解。23.如權利要求22所述的方法,其特征在干,使用質量分析儀選擇對ー種或多種已知的質量標記物特異的具有特定質量或質量范圍的離子,使所選擇的離子分解,然后檢測分解產物,以鑒別指示所選擇的質量標記物的離子模型。24.如權利要求22或23所述的方法,其特征在于,所述質譜儀包括三個四極質量分析儀。25.如權利要求23或24所述的方法,其特征在于,所述第一質量分析儀用于選擇具有特定質量或質量范圍的離子,第二質量分析儀用于分解所選擇的離子,第三個質量分析儀用于檢測所產生的離子。26.如權利要求18-25中任一項所述的方法,其特征在于,所述方法包括 (a)使ー種或多種分析物與一組探針接觸,其中,所述探針是權利要求14-17中任ー項所定義的探針; (b)通過檢測與分析物相關的探針鑒別分析物。27.如權利要求26所述的方法,其特征在于,在采用質譜法檢測所述質量標記物前,先將質量標記物從所述探針上解離下來。28.如權利要求26或27所述的方法,其特征在于,所述方法包括使ー種或多種核酸與ー組雜交探針接觸。29.如權利要求28所述的方法,其特征在于,所述一組雜交探針是具有256個以內的四聚體的組,組中各探針具有不同的核酸堿基的組合。30.如權利要求18所述的ニ維質譜分析法,其特征在于,該方法包括 (a)提供兩種或多種分析物,各分析物用質量標記物或質量標記物的組合標記,其中,這些質量標記物來自權利要求1-13中任ー項所定義的質量標記物組; (b)使所述質量標記物與所述分析物解離; (c)檢測質量標記物; (d)在質譜儀中分解質量標記物,以從質量歸ー化部分釋放出質量指示部分; (e)檢測質量指示部分; (f)在所述質量標記物的質譜和所述質量指示部分的質譜的基礎上鑒別分析物。31.如權利要求30所述的方法,其特征在于,在所述(c)步驟中,選擇具有選定的質量或質量范圍的質量標記物用于檢測,和/或在(e)步驟中,選擇具有特定質量的質量指示部分用于檢測。32.如權利要求18所述的分析方法,其特征在于,該方法包括 (a)在分析物的第一特性的基礎上,對標記的分析物的混合物進行第一分離處理; (b)在分析物的第二特性的基礎上,對所得的分離分析物進行第二分離處理; (C)通過檢測分析物的標記物,從而檢測該分析物; 其中,這些分析物用來自權利要求1-13中任ー項所定義的質量標記物組或陣列的質量標記物標記。33.如權利要求32所述的方法,其特征在于,在(a)步驟和/或(b)步驟中,根據所述分析物的長度或質量將它們分離。34.如權利要求32或33所述的方法,其特征在于,在(a)步驟和/或(b)步驟中,根據所述分析物的等電點將它們分離。35.如權利要求32-34中任一項所述的方法,其特征在于,所述分析物包括蛋白質、多肽、肽、氨基酸或核酸,或者它們的片段。36.如權利要求32-35中任一項所述的雙向凝膠電泳法。37.根據權利要求18所述的表征核酸的方法,其特征在于,該方法包括 (a)提供ー組核酸片段,各片段具有可斷裂地連接于其上、用于鑒別該片段的特征的質量標記物,所述質量標記物來自權利要求1-13中任ー項所定義的質量標記物組的質量標記物;(b)在它們的長度的基礎上分離這些片段; (C)解離各片段,使其釋放出其質量標記物; (d)采用質譜法測定各質量標記物,以描述各片段的特征與片段長度的關系。3...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:G·施密斯A·H·托馬斯R·A·W·約翰斯通
    申請(專利權)人:電泳有限公司
    類型:發明
    國別省市:

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