本發明專利技術涉及用于對肝細胞癌復發進行診斷的單核苷酸多態性(SNP),其中,所述SNP顯示出與肝細胞癌術后復發風險的顯著相關性。因此,可將所述SNP用于開發對肝細胞癌復發進行診斷的微陣列或診斷試劑盒;以及用于篩選預防肝細胞癌復發的藥物,從而預防肝細胞癌的術后復發。
【技術實現步驟摘要】
【國外來華專利技術】
本專利技術涉及用于對肝細胞癌術后復發進行預測的單核苷酸多態性(SNP)、使用該SNP對肝細胞癌復發進行預測的微陣列或測試試劑盒、以及篩選減少肝細胞癌復發的藥物的方法。
技術介紹
從癌癥發育和死亡的角度來看,在韓國,肝細胞癌(HCC)是所有惡性腫瘤中第三常見且嚴重的癌癥。肝細胞癌是最富血管性的腫瘤之一。對HCC進行治療的最有效的方式是外科切除術或肝移植。然而,由于不能移除的腫瘤的大小和數量、肝功能不良、各種肝內轉移或肝外轉移等原因,只有10%-20%的肝細胞癌患者能進行手術。即使對于可進行手術的肝細胞癌患者來說,頻繁的術后復發也是長期 生存率的主要限制因素。肝細胞癌的發育和快速發展涉及多種機制。其中,通過缺氧促進血管生成起了非常重要的作用。另外,在肝中的缺氧環境下,轉移性腫瘤抗原I (MTAl)通過在結構上使缺氧誘導因子I (HIF I)穩定來增強血管內皮生長因子(VEGF)的表達,從而有助于惡性腫瘤的血管生成(MoonEJ 等,2004 ;Moon EJ 等,2006)。同時,在感染乙型肝炎病毒后,約有5%_10%變成慢性乙型肝炎,其中一些可能會發展成肝硬化或肝細胞癌。像這樣,可以理解的是,感染乙型肝炎病毒后所表現出的各種臨床發展取決于每個個體的遺傳易感性(genetic predisposition)的差異和病毒自身的差巳遺傳易感性意味著在個體間的不同基因中存在細微差異。近年來,通過基因組研究報道了不同個體間的差異水平。在遺傳變異中,已知單核苷酸多態性(SNP)改變基因功能,并且迄今為止在人類基因組中已報道了約1100萬個SNP中的710,000個多態性(NCBI,dbSNP)。近年來,為了確定堿基序列中的細微變化是否確實影響對某些疾病的敏感性(susceptibilities)、以及為了發現對疾病易感的遺傳變異,正在積極地進行著大量研究(Ludwig JA 和 Weinstein JN, 2005 ;Suh Y 和 Vijgj,2005 ;Chanock S,2001)。
技術實現思路
技術問題為解決傳統技術中的上述問題,本專利技術人發現SNP表現出與肝細胞癌術后的復發具有有意義的相關性。由此完成了本專利技術。因此,本專利技術的目的是提供用于對肝細胞癌術后復發進行預測的單核苷酸多態性(SNP)0另外,本專利技術的另一目的是提供使用單核苷酸多態性(SNP)對肝細胞癌復發進行預測的微陣列。另外,本專利技術的另一目的是提供對肝細胞癌復發進行預測的測試試劑盒。另外,本專利技術的另一目的是提供使用單核苷酸多態性(SNP)對肝細胞癌復發進行預測的方法。另外,本專利技術的另一目的是提供使用單核苷酸多態性(SNP)篩選預防肝細胞癌復發的藥物的方法。技術方案為實現上述目的,本專利技術的示例性實施方式提供了用于對肝細胞癌復發進行預測的單核苷酸多態性(SNP),其中,所述SNP包括選自于由下列多核苷酸或者它們的互補核苷酸所組成的組中的至少一種多核苷酸IGF2基因的-291C/G(rs3213221)中的C等位基因(CC基因型或GC基因型);IGF2基因的-13021C/T(rs3741208) 中的T等位基因(CT基因型或TT基因型);FGF2基因的66378C/T (rsl048201) 中的T等位基因(CT基因型或TT基因型);FGF2基因的50012A/G (rs6534367) 中的G等位基因(GG基因型或GA基因型);IGF2基因的6310 (rs2585) /4702 (rs3802971) 中的 GC 單倍型;IGF2 基因的-11228 (rs2239681)/-13021 (rs3741208) 中的純合 CC 單倍型;以及 IGF2 基因的-11228 (rs2239681) /-13021 (rs3741208) 中的 CT 單倍型。肝細胞癌的復發可能與經根治性外科切除術治療的HCC患者的根治性外科切除術后的肝細胞癌復發相關。另外,本專利技術的示例性實施方式提供了用于對肝細胞癌復發進行預測的微陣列,其中,所述微陣列包含用于對根治性外科切除術后的肝細胞癌復發進行預測的單核苷酸多態性(SNP)的多核苷酸、由該多核苷酸編碼的多肽或其cDNA。另外,本專利技術的示例性實施方式提供了用于對肝細胞癌復發進行預測的測試試劑盒,所述試劑盒包含所述微陣列。除本專利技術的微陣列外,本專利技術所述的測試試劑盒可進一步包含引物組,所述引物組用于從臨床樣本中分離和擴增出包含相關SNP的DNA。另外,本專利技術的實施方式提供了用于對肝細胞癌復發進行預測的測試試劑盒,所述試劑盒利用單堿基延伸(SBE)反應對SNP進行基因分型。對利用單堿基延伸反應來預測肝細胞癌復發的測試試劑盒進行設計,以證實是否存在下述基因型IGF2基因的-291C/G(rs3213221)中的C等位基因(CC基因型或 GC 基因型);IGF2 基因的-13021C/T (rs3741208) 中的 T 等位基因(CT基因型或 TT 基因型);IGF2 基因的 6310 (rs2585) /4702 (rs3802971) 中的純合GC單倍型;以及 IGF2基因的-11228(rs2239681)/-13021(rs3741208) 中的 CT 單倍型。本專利技術的實施方式提供了用于對肝細胞癌復發進行預測的測試試劑盒,所述試劑盒利用了單堿基延伸反應,所述試劑盒包含用于擴增IGF2基因的-13021 (rs3741208)區的正向引物;用于擴增IGF2基因的-13021 (rs3741208)區的反向引物;用于對IGF2基因的-13021 (rs3741208)區進行基因分型的引物;用于擴增IGF2基因的6310 (rs2585)區的正向引物;用于擴增IGF2基因的6310(rs2585)區的反向引物;用于對IGF2基因的6310(rs2585)區進行基因分型的引物;用于擴增IGF2基因的-11228 (rs2239681)區的正向引物;用于擴增IGF2基因的-11228 (rs2239681)區的反向引物;用于對IGF2基因的-11228(rs2239681)區進行基因分型的引物;用于擴增IGF2基因的4702 (rs3802971)區的正向引物;用于擴增IGF2基因的4702 (rs3802971)區的反向引物;用于對IGF2基因的4702(rs3802971)區進行基因分型的引物;用于擴增IGF2基因的-291C/G (rs3213221)區的正向引物;用于擴增IGF2基因的-291C/G(rs3213221)區的反向引物;以及用于對IGF2基因的-291C/G (rs3213221)區進行基因分型的引物。根據實施方式,在用于對肝細胞癌復發進行預測的測試試劑盒中,用于擴增IGF2基因的-13021 (rs3741208)區的正向引物可為引物SEQ IDN0. 17 ;用于擴增IGF2基因的-13021 (rs3741208)區的反向引物可為引物SEQ ID NO. 18 ;用于對IGF2基因的-13021(rs3741208)區進行基因分型的引物可為引物SEQ ID NO. 35 ;用于擴增IGF2基因的6310(rs2585)區的正向引物可為引物SEQ ID NO. 20 ;用于擴增IGF2基因的6本文檔來自技高網...
【技術保護點】
【技術特征摘要】
【國外來華專利技術】...
【專利技術屬性】
技術研發人員:鄭永化,維銀實,李榮柱,金精我,李宗殷,
申請(專利權)人:蔚山大學校產學協力團,
類型:
國別省市:
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