本發明專利技術公開了一種SLC22A1基因檢測液相芯片和特異性引物，該液相芯片主要包括有：每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為：針對C117T位點的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；針對T198C位點的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；針對C86T位點的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；針對C97G位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26；針對C164T位點的SEQ?ID?NO.27及SEQID?NO.28；針對G123T位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；針對G127A位點的SEQ?IDNO.31及SEQ?ID?NO.32；針對A148G位點的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；和/或針對G129C位點的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本發明專利技術所提供的檢測液相芯片的檢測結果與測序法的吻合率高達100％，實現多個突變位點的野生型和突變型并行檢測。
【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于分子生物學領域，涉及醫學和生物技術，具體的是涉及一種SLC22A1基因多態性檢測特異性引物和液相芯片。
技術介紹
有機陽離子轉運體I (0CT1，編碼基因SLC22A1)是一種具有基因多態性的轉運蛋白，主要分布于人的肝臟，介導一些藥物、毒物和內源性化合物等一系列有機陽離子的轉運。SLC22A1在許多外源性藥物的吸收、分布和排泄中發揮著重要的作用。有研究表明，SLC22A1基因多態性是造成其轉運功能個體差異的主要原因。目前，對SLC22A1基因多態性進行檢測和分析的方法很少，主要有直接測序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突變造成的限制性內切酶識別位點的改變，如位點丟失或產生新位點，通過PCR擴增某一特定片段，再用限制性內切酶酶切擴增產物，電泳觀察片段的大小，這種方法用于檢測酶切位點改變的基因突變，可直接判斷基因型，但該法不能用于沒有產生新酶切位點的基因突變檢測。再次，以上這些方法都存在著檢測通量的局限性，每次只能檢測一種突變類型，不能滿足實際應用的需要。本專利技術目標檢測的SLC22A1基因突變位點，如表所示 序號 SLC22A1位點突變的內容簡寫~SEQ ID NO. 75的第117位核苷酸，發生C —T突變C117T 2SEQ ID NO. 75的第198位核苷酸，發生T — C突變T198C~SEQ ID NO. 76的第86位核苷酸，發生C — T突變C86T~SEQ ID NO. 76的第97位核苷酸，發生C — G突變C97G 5SEQ ID NO. 77的第164位核苷酸，發生C — T突變C164T ~6SEQ ID NO. 78的第123位核苷酸，發生G — T突變G123T ~1SEQ ID NO. 79的第127位核苷酸，發生G — A突變G127A SEQ ID NO. 79的第148位核苷酸，發生A — G突變A148G 9SEQ ID NO. 80的第129位核苷酸，發生G — C突變G129CSEQ ID NO. 75TCCTCATCTTATGCCTGCTGTCGGCTGCCTTTGCGCCCATCTGTGTGGGCATCGTCTTCCTGGGTTTCACACCTGACCACCACTGCCAGAGTCCTGGGGTGGCTGAGCTGAGCCAGCGCTGTGGCTGGAGCCCTGCGGAGGAGCTGAACTATACAGTGCCAGGCCTGGGGCCCGCGGGCGAGGCCTTCCTTGGCCAGTGCAGGCGCTATGAAGTGGACTGGAACCAGAGCGCCCTCAGCTGTGTAGACCCCCTGGCTAGCCTGGCCACCAACAGGAGCCACCTGCCGCTGGGTCCCTGCCAGGATGGCTGGGTGTATGACACGCCCGGCTCTTCCATCGTCACTGSEQ ID NO. 76GAGCAACAGCATCACCCCGCTCAGGGCTGAACGTCAGACCGAGGAAAATGCCAGATAGTGATGAGTGGTGTTCGCAGGTGTGTGCCGGAGTCCCCTCGGTGGCTGTTATCACAAAAAAGAAACACTGAAGCAATAAAGATAATGGA CCACATCGCTCAAAAGAATGGGAAGTTGCCTCCTGCTGATTTAAAGGTGAAATCTAGGAAGGGGTATCTCACATCACTGAATCTGGGGCTGGGTTCTGGTGCAGATTCGTCTGGGGCTGCCAGGGGAAAGAGCAGAACTGTGCCCCTSEQ ID NO. 77 GAAGCACGGTGGTGGCAAGGCTCACCTCCCCAGGGGCTCCCAGGTGGCTCTGCTCATGACAGCGTGAGTGTGGCTGATGCTCTCCCTCCCTCCTAGATGCTTTCCCTCGAAGAGGATGTCACCGAAAAGCTGAGCCCTTCATTTGCAGACCTGTTCCGCACGCCGCGCCTGAGGAAGCGCACCTTCATCCTGATGTACCTGTGGTGAGGGGCGTTCCTGTGCGTCTCTCCAGGCAGAATCAGCACGCTYGCCCAAGCACTGGGCTATAGATTAGAGACAGTGGAATACTCAGGTGGAAAAAGAGAAAGGGAAASEQ ID NO. 78CCTGGGAACTGTGCTGGTCAACGCGGTGTCGGGCGTGCTCATGGCCTTCTCGCCCAACTACATGTCCATGCTGCTCTTCCGCCTGCTGCAGGGCCTGGTCAGCAAGGGCAACTGGATGGCTGGCTACACCCTAAGTAATTATCATGGGGATGAGGCCAGGTCTCAGGGTAGAATGGGATGGGCCTAACGTGGGTAGGGGGTTGTTTGTGGGGTCAAGGAGCTTGCGGGGCACCAGTTCCTTGTATTTATGTGACTAGGGCAGGACATGGGCTSEQ ID NO. 79GTGCTCTATCAGGGGCTCATCCTGCACATGGGCGCCACCAGCGGGAACCTCTACCTGGATTTCCTTTACTCCGCTCTGGTCGAAATCCCGGGGGCCTTCATAGCCCTCATCACCATTGACCGCGTGGGCCGCATCTACCCCATGGCCATGTCAAATTTGTTGGCGGGGGCAGCCTGCCTCGTCATGATTTTTATCTCACCTGGTAAGTTGGTAAGTTGTCTGCTTTCATCATTTCCCAGGCAATCGAAGTGTGGGGAAAGTGTTGTGACTCTTTGATAAGCCTCTGGAATGAGAACAAAGATGAGGTGCSEQ ID NO. 80GAGCACTGGACAGCCACAGCAAGCTGCAGGTATTGGCATTGTACTTGTTTTAGCATCAGGTGAACATTTGGAAAAGTGAATCACAGAATTATCGTATTTTTTGTCCTTTGTATTTTATCAGGAACCTCGGAGTGATGGTGTGTTCCTCCCTGTGTGACATAGGTGGGATAATCACCCCCTTCATAGTCTTCAGGCTGAGGGAGGTCTGGCAAGCCTTGCCCCTCATTTTGTTTGGTAAGATTTTGTGGAGCATATATCATTCCTTCTTTTGCAGCTCGGCAGTGGGCTCAGCATGGGTGGAACTGAGTGTGAGTACTCAGTCGTATTTGTTGAGTGAAGGGAATGATATCTCTCAGTGAGTTTACAGAAGGCAAGGATGATGCATGCTCTTGGGATGTCTTCTGGCTTA
技術實現思路
本專利技術的目的之一是提供SLC22A1基因多態性檢測液相芯片，該液相芯片可用于單項或者并行檢測SLC22A1基因九種常見基因型C117T、T198C、C86T、C97G、C164T、G123T、G127A、A148G和G12本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種SLC22A1基因多態性檢測液相芯片，其特征是，包括有：(A).針對SLC22A1基因不同多態性位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物對：每條ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態性位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為：針對C117T位點的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；針對T198C位點的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；針對C86T位點的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；針對C97G位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26；針對C164T位點的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28；針對G123T位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；針對G127A位點的SEQ?ID?NO.31及SEQ?IDNO.32；針對A148G位點的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；和/或針對G129C位點的SEQ?IDNO.35及SEQ?ID?NO.36；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.18；(B).有anti?tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti?tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti?tag序列選自SEQ?ID?NO.37～SEQ?ID?NO.54，且所述anti?tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應多態性位點的目標序列的引物。...
【技術特征摘要】
【專利技術屬性】
技術研發人員：許嘉森，羅可銀，
申請(專利權)人：廣州益善生物技術有限公司，
類型：發明
國別省市：
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